נולד בא' תמוז ה'תרצ"ד בירושלים, אביו שעסק לפרנסתו במכירת ספרים ותשמישי קדושה, הוא נינו של משה זאקס, ראשון העולים לארץ ישראל מגרמניה במאה ה-19 הוא עלה ארצה בשנת ה'תקע"א ממיינינגען שבגרמניה, והיה תלמידו של החתם סופר.
אהרון התחנך בתלמוד תורה "עץ חיים" ומשם עבר לישיבת סלבודקה בבני ברק, שם יצא שמו כעילוי וכתלמיד חכם הבקיא בכל חדרי התורה.
בשנת תשי"ט נשא את זוגתו הרבנית רבקה בת רבי טוביה יוסף לנדו אחותו של ראש הישיבה הרב דב לנדו.
אשתו, הרבנית רבקה זקס, ניהלה במשך עשרות שנים את סמינר "אור החיים", ונולדו להם שלשה בנים ושלש בנות.
בנו הרב יעקב זקס הוא ראש ישיבת שערי דעת.
בנו הרב ברוך מרדכי זקס ממלא מקומו בראשות הישיבה.
חתנו הרב שמעון שרייבר הוא בנו של רבי פנחס שרייבר ומשמש כראש כולל "עטרת שלמה" בבני ברק.
חתנו הרב משה ליברמן ראש כולל במודיעין עילית ומתלמידי רבי ישראל אליהו וינטרוב.
בשנת תשכ"ו מונה על ידי רבי מרדכי שולמן לעמוד בראשות ישיבת סלבודקה לצעירים שנוסדה אז, (תפקיד בו כיהן עד לפטירתו) שם הפליא בעומק שיעוריו העיוניים ובדרך הרבצת התורה המיוחדת שלו. אל שיעוריו ושיחותיו היו מגיעים צורבי מרבנן גם מחוץ לישיבה שביקשו לקנות דעת וחוכמה.
במקביל לתפקידו כראש ישיבה, פעל רבות למען הציבור החרדי בבני ברק בעיקר בתחום רפואה ע"פ ההלכה, ושימש כחבר מועצת מכבי שירותי בריאות. בביתו נחתמו הסכמי שיתוף פעולה בין בית החולים מעיני הישועה למכבי שירותי בריאות ובחנוכת הבית למרכז מכבי ברחוב רבי עקיבא בבני ברק קבע הרב זקס מזוזה בבנין.
בכ"ה באדר ה'תשע"ז נפטר הרב זקס לאחר שהיה מאושפז חודשיים בבית החולים מעיני הישועה, הלוויתו יצאה מהיכל ישיבת סלבודקה לצעירים והוא נקבר בהר הזיתים.
אחיו הם:
רבי עמרם יצחק זקס - ראש ישיבת סלבודקה.
הרב דב זקס - מרבני ישיבת סלבודקה לצעירים.
שמואל יהודה - חלל צה"ל שנהרג בשנת 1956.
גיסו הוא הרב דב לנדו ראש ישיבת סלבודקה בבני ברק, ואחיינו (חתן אחיו) הוא הרב יצחק שורץ המכהן גם הוא כראש ישיבת סלבודקה.
0
